红薯由于含水量高，贮藏期间极易生软腐病，该病是红薯采收和贮藏期的重要病害，如不加以重视，就会造成红薯大量腐烂。
1.发生条件 软腐病病原是葡枝根霉，属结合菌亚门真菌。该菌存在于空气中，或附着在被害薯块上，或在贮藏窖内越冬。薯块处在温度15℃～25℃、相对湿度在75%～85%环境下最适宜该菌繁殖。薯块有伤口时或甘薯受冻后最容易感染而发病。
2.主要症状 软腐病菌主要感染薯块，染病初期在薯块表面长出灰白色霉状物，然后变为黑色或灰暗色，病变组织变成淡褐色水浸状，最后在病变表面长出大量灰黑色黑丝及孢子囊，形成一大片黑色毛状物，在适宜条件下扩展迅速，约二三天整个薯块呈软腐状，发出难闻的恶臭味。
3.防治方法 对软腐病要采取综合措施防治，主要做好以下3个方面的工作：
一是适时收获，避免机械伤害。夏薯要在霜降前后收完，秋薯要在立冬前收完，要选晴天收获，挖薯时尽量减少或避免产生伤口。
二是要精选健薯，做到安全入窖。在红薯入窖前要精选，淘汰病、残、烂薯，水气晾干后入窖，尽量用新窖。旧窖用前要把窖内旧土铲除露出新土，也可每平方米用硫磺15克进行熏蒸消毒杀菌。
三是要加强管理，降湿、保温和通风。
①贮藏前期，即入窖后30天内，由于薯块生命活力旺盛，呼吸强度大，放出大量的热量、水汽和二氧化碳，从而形成高温高湿的环境条件，因此这段时间的主要工作是通风、降温和散湿，温度控制在15℃以下，湿度控制在90%～95%。具体措施就是利用通风孔或门窗，有条件的利用排风扇，加强通风。如果白天温度高，可以采取晚上打开、白天关闭的方法；以后随着温度的逐渐下降，通风孔可以日开夜闭，待窖温稳定在15℃以下时可不再通风。
②贮藏中期，即前期过后到立春的这段时间，是一年中最冷的季节，外界气温很低，同时薯块呼吸作用随着温度的下降而减弱，放出的热量减少，因此窖温降低，是薯块最容易受冷害的时期，保温防寒是这段时期的工作重点，使窖温不低于10℃，最好控制在12℃～14℃之间。具体措施：封闭通风孔或门窗，加厚窖外保温层，薯堆上覆盖草垫或软草。
③贮藏后期，即开春以后（3月份）外界气温逐渐升高，要经常检查窖温，保持在10℃～14℃之间，中午温度过高及时放风，傍晚及时关闭风口，使窖温保持在适宜范围之内。